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传染性不同:
百日咳是呼吸道的传染病，普通咳嗽不是传染病，也未必是感染性的疾病。
致病因不同:
百日咳是由百日咳杆菌感染所导致，而普通咳嗽未必是感染所导致，理化因素的刺激也会导致普通的咳嗽。
致病人群不同:
百日咳通常侵犯六岁以下的孩子，包括新生儿在内，而不论年龄，都可以产生普通的咳嗽。
病程不同:
百日咳的病程比较长，有些患儿可以长达数月，而普通咳嗽在除去理化因素、辛辣食物的刺激，或者经过正确的治疗，就能在3-5天、1-2个星期内得到好转。
咳嗽表现不同:
百日咳的患儿通常有痉挛性的咳嗽，痉挛性的咳嗽主要表现在一阵剧烈的咳嗽后，会有较长的像鸡鸣一样的喉鸣音，而普通的咳嗽就是比较干脆利落的咳嗽反射。
通过以上几点，区别百日咳和普通咳嗽比较容易。
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